天然产物研究主要以天然药用植物及其真菌资源为研究对象，探讨其化学组成、合成、工艺和药用植物与其真菌之内之间互作关系等的一门基础研究和应用基础研究学科，同时也是从分子水平上研究药用植物及真菌基因、蛋白、多糖的功能,探索和认识药用植物及真菌的生命活动规律的重要学科之一。
　　当前研究的重点：
　　1.围绕国家战略目标和需求,以药用植物及真菌为资源，应用各种生物活性筛选技术(与国内相关研究机构合作，筛选和随机筛选相结合)，发掘结构新颖化合物和活性成分，加速能治疗癌症及心血管病的化合物的筛选；
　　2.综合各学科理论，开展分离、鉴定、活性追踪和评价的集成研究方法（本研究具有创新性和挑战性，影响力很大）；
　　3.开展药用植物及真菌内有效成分的提取分离及衍生物的化学合成的优化工艺研究，为药业企业服务；
　　4.开展具有重要药用活性的天然产物在生物体系中的动态研究；
　　5.建立与活性化合物配套的天然产物库(包括化合物、组分、提取物等)，同时建立相应的数据库(包括结构信息、活性信息和资源信息等，类似药物成品资源平台建设)；
　　6.开展以天然产物为探针的作用机理研究，探索人类对自然界中各种生命现象的认识；
　　7.开展药用植物真菌资源库的建设，以其中几种模式真菌为研究对象，同时开展药用植物组织学和细胞学研究，研究真菌与药用植物细胞的互用关系，以DNA、蛋白、多糖的代谢纽带，研究它们的协同与抑制机制。